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云南省臨床醫學研究中心（以下簡稱“省級中心”）是面向云南省疾病防治需求，以臨床應用為導向，以具有獨立法人資格的醫療機構為主體，以協同網絡為支撐，開展臨床研究、協同創新、學術交流、人才團隊培養、新藥和醫療器械臨床試驗、成果轉化、推廣應用的技術創新與成果轉化類省級科技創新基地。

據《云南省臨床醫學研究中心暫行管理辦法》（以下簡稱《管理辦法》），根據云南省疾病防治需求，在主要疾病領域、地方病領域和具有優勢特色的臨床專科布局建設省級中心。各省級中心結合本領域疾病防治研究重點，建設省級分中心，搭建疾病研究協同創新網絡，聯合國際、省際、州（市）、縣醫院和基層醫療機構等，協同開展本疾病領域和相關疾病間的防控研究、疾病診療指南（規范）制定、技術培訓、適宜技術和研究成果的轉移轉化及推廣、遠程醫療、臨床指導和國際合作等工作。

《管理辦法》提出，對新確認的省級中心，確認次年省級財政科技經費給予補助。對績效評估結果為優秀和合格的臨床中心，評估次年根據評估等次省級財政科技經費分別給予補助。

此外，鼓勵醫研企結合，打造各疾病領域覆蓋全省的網絡化、集群化協同創新網絡和轉化推廣體系。以市場為導向，鼓勵多渠道籌措資金加強臨床中心建設。